Spatio-Temporal Modeling

Spatial Statistics

Summary of Poisson Regression in Spatio-Temporal Model

Yeongeun Jeon
02-08-2021

Poisson Regression


Relative Risk

실제로 \(y\)의 평균 보다 "Rate" or "Relative Risk"에 더 관심있으며, Poisson Regression의 목적은 Relative Risk을 추정하는 것이다. 왜냐하면 단순히 “수”로는 어느 게 크고 작은지 또는 높고 낮은지 정확하게 판단할 수 있는 기준이 없기 때문이다.

\[\begin{align*} y_{i} &\thicksim Poisson(\lambda_{i}), \;\; \lambda_{i} = E_{i}\rho_{i}\\ \eta_{i} &= \log{\rho_{i}}= \log{\frac{\lambda_{i}}{E_{i}}} = \beta_{0}+ \sum_{j} \beta_{j}x_{ji}\\ \beta_{j} &\thicksim Normal \end{align*}\]

Estimation of Relative Risk

실제로 상대적 위험(Relative Risk)의 추정값으로 가장 많이 쓰이는 것은 SMR(Standardized Mortality Ratio)이다.

\[\begin{align*} \hat{\rho}_{i} = \frac{y_{i}}{E_{i}} \end{align*}\]


Spatial Model

Expected Case

흔하게 사용하는 예상되는 수 (\(E_{i}\))는 \[\begin{align*} E_{i} = n_{i}\frac{\sum y_{i}}{\sum n_{i}}, \end{align*}\]

(참고 : Bayesian Disease Mapping: Hierarchical Modeling in Spatial Epidemiology p.85)


Estimation of Relative Risk

\[\begin{align*} \hat{\rho_{i}} &= \frac{y_{i}}{E_{i}} = \frac{y_{i}/n_{i}}{\sum y_{i}/ \sum n_{i}}. \end{align*}\]


BYM Model

\(i\)번째 지역에서의 결과값을 \(y_{i}\)라고 할 때,

\[\begin{align*} y_{i} &\thicksim Poisson(\lambda_{i}), \;\; \lambda_{i} = E_{i}\rho_{i}\\ \eta_{i} &= \log{\rho_{i}} = b_{0} + u_{i} + v_{i} \end{align*}\]

Spatial Effect

구조화된 공간 효과(\(u_{i}\))

\[\begin{align*} &u_{i} \vert u_{-i} \thicksim N(m_{i}, s^2_{i}),\\ &m_{i} = \frac{\sum_{j \in \mathcal{N}_{i}} u_{j}}{{\# \mathcal{N}_{i}}} ,\;\; s^2_{i} = \frac{\sigma^2_{u}}{\# \mathcal{N}_{i}}, \end{align*}\]

비구조화된 공간 효과(\(v_{i}\))

\[\begin{align*} v_{i} \thicksim N(0, \sigma^2_{v}) \end{align*}\]



Spatial-Temporal Model

Expected Case

흔하게 사용하는 예상되는 수 (\(E_{it}\))는 \[\begin{align*} E_{it} = n_{it}\frac{\sum_{t}\sum_{i} y_{it}}{\sum_{t}\sum_{i} n_{it}}, \end{align*}\]

(참고 : Bayesian Disease Mapping: Hierarchical Modeling in Spatial Epidemiology p.293)


Estimation of Relative Risk

\[\begin{align*} \hat{\rho_{it}} &= \frac{y_{it}}{E_{it}} = \frac{y_{it}/n_{it}}{\sum_{t}\sum_{i} y_{it}/\sum_{t}\sum_{i} n_{it}}. \end{align*}\]


Classical Parametric Trend

\(t\)시간에서 \(i\)번째 지역의 결과값을 \(y_{it}\)라고 할 때, \[\begin{align*} y_{it} &\thicksim Poisson(\lambda_{it}), \;\; \lambda_{it} = E_{it}\rho_{it}\\ \eta_{it} &= \log{\rho_{it}} = b_{0} + u_{i} + v_{i} + (\beta+\delta_{i})*t\\ \delta_{i} &\thicksim N(0, \sigma^2_{\delta}) \end{align*}\]

Classical Parametric Trend는 선형추세만을 가정한다


Nonparametric Dynamic Trend

\(t\)시간에서 \(i\)번째 지역의 결과값을 \(y_{it}\)라고 할 때, \[\begin{align*} y_{it} &\thicksim Poisson(\lambda_{it}), \;\; \lambda_{it} = E_{it}\rho_{it}\\ \eta_{it} &= \log{\rho_{it}} = b_{0} + u_{i} + v_{i} + \gamma_{t} + \phi_{t} \end{align*}\]

Nonparametric Dynamic Trend는 선형성 조건을 완하하기 위하여 Dynamic nonparametric 형태를 취한다.

Time Effect

Nonparametric Dynamic Trend는 시간적으로 구조화된 요소(\(\gamma_{t}\))와 비구조화된 요소(\(\phi_{t}\)) 두 가지를 모두 고려한다.

구조화된 시간 효과(\(\gamma_{i}\))

Nonparametric Dynamic Trend에서 구조화된 시간 효과(\(\gamma_{t}\))는 Random Walk(RW)를 사용하여 모형화한다.

\[\begin{align*} \gamma_{t} \vert \gamma_{t-1} \thicksim N(\gamma_{t-1}, \sigma^2_{\gamma}), \text{RW of order 1},\\ \gamma_{t} \vert \gamma_{t-1}, \gamma_{t-2} \thicksim N(2\gamma_{t-1} + \gamma_{t-2}, \sigma^2_{\gamma}), \text{RW of order 2} \\ \end{align*}\]

비구조화된 시간 효과(\(\phi_{t}\))

\[\begin{align*} \phi_{t} \thicksim N(0, \sigma^2_{\pi}) \end{align*}\]



Spatial-Time Interaction

공간 및 시간 모형은 전반적인 공간과 시간 패턴을 파악하기 때문에, 모든 시간 또는 모든 공간에 대해 변하지 않는다. 그렇기 때문에 시공간 상호작용은 공간과 시간의 주요 요인으로 설명되지 않는 추과 효과를 포착할 수 있다. 또한 시간에 따른 공간 패턴도 파악 할 수 있으며, 각 지역의 추세도 파악할 수 있다. 시공간 상호작용은 다음과 같은 네가지의 Type을 가진다.

Interaction Parameter interacting
Type I \(v_{i}\) and \(\phi_t\)
Type II \(v_{i}\) and \(\gamma_t\)
Type III \(u_{i}\) and \(\phi_t\)
Type IV \(u_{i}\) and \(\gamma_t\)

\(t\)시간에서 \(i\)번째 지역의 결과값을 \(y_{it}\)라고 할 때, \[\begin{align*} y_{it} &\thicksim Poisson(\lambda_{it}), \;\; \lambda_{it} = E_{it}\rho_{it}\\ \eta_{it} &= \log{\rho_{it}} = b_{0} + u_{i} + v_{i} + \gamma_{t} + \phi_{t} + \delta_{it} \end{align*}\]


Spatial Effect


Time Effect


Spatial-Time Interaction

Reuse

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